鲤之助已经离去很久了，自由也渐渐忘却了以前刺激的经历，但短暂的和平气氛随着一个矮小身躯的神秘人出现在自由家而宣告结束。此人正是鲤之助的孩子鲇之助，拿着心型眼带，为了未来的战斗再次追随着父亲的足迹。而曾经的对手，现在是自由朋友的御影也因担心自由的安危来到她的身边保护她。自由的学校中，新转来一个日俄混血的女孩：菲利莎。谁也没想到这个可爱活泼的女孩竟然是柳生十兵卫的亲女儿。她为了夺回第二代十兵卫的头衔与心型眼带，接近自由。表面上与自由亲热无比，暗底下却包藏祸心。正当自由身边危机迸发之际，柳生同门的另一宿敌：柳生喜多烈斋的后人又来捣乱。自由将如何决定自己的未来呢？